Om de ecologische ontwikkeling van Markermeer-IJmeer te monitoren is de Natuurthermometer in 2014 ontwikkeld. De Natuurthermometer brengt driejaarlijks in beeld de actuele situatie over de realisatie van de gestelde systeemcondities: Toekomstbestendig Ecologisch Systeem (TBES).
In deze vierde uitlezing (2021 t/m 2023) worden de ontwikkelingen binnen Natura 2000, de Kaderrichtlijn Water (KRW) en TBES in beeld gebracht.
De rapportage laat een gemengd beeld zien: terwijl sommige doelen ruim worden gehaald – zoals delen van de broedvogel- en waterplantenindicatoren – blijven andere achter, met name bij habitatrichtlijnsoorten en visetende watervogels. Ook recente natuurontwikkelingen, zoals de uitbreiding van Marker Wadden en Trintelzand, laten hun positieve effect zien op broed- en foerageergebieden.
De Natuurthermometer biedt hiermee waardevolle inzichten voor bestuurders, beleidsmakers, gebiedspartners en initiatiefnemers die werken aan het versterken van de natuurwaarde van het Markermeer-IJmeer. Daarnaast helpt het ook om deze partijen en de omgeving te informeren over de ecologische toestand van het Markermeer-IJmeer.
Sinds 2025 valt het uitlezen van de Natuurthermometer onder het werkspoor Waterkwaliteit, Ecologie en Biodiversiteit (WEB). Voor die tijd werd het uitgevoerd door de Ambtelijke werkgroep Markermeer IJmeer (AMIJ) en gefinancierd door de Provincie Flevoland.
